Flaggan antogs samma år som Mauretanien blev självstyrande republik, år 1959, men landet höll fortfarande särskilda förbindelser med det
franska samväldet. Den gröna färgen är känt för att stå för den muslimska religionen som är den religion som är mest utbredd i landet. Månskäran med stjärnan är även en tradtionell muslimsk symbol, och härstammar från det Osmanska riket.
Den gröna och gula färgen ingår även i de panafrikanska färgerna och i flaggan påvisar landets geografiska läge i
Afrika. Grönt är även en klassisk färg för att symbolisera hopp och den gula kan även ses som sanden i Sarahas öken.