Både månskäran med stjärnan och den gröna färgen är klassika symboler för islam. I den pakistanska flaggan har man utformat flaggan med större delen i grönt för att visa på att majoriteten är muslimer och den vita färgen är för minoriteterna av annan religion än islam. Månskäran och stjärnan är även en symbol för framsteg och ljus.
Flaggan har sitt ursprung ur All India Muslim League, en organisation som kämpade för en självständig muslimsk stat, på den
indiska subkontitenten efter att den
brittiska eran gått mot sitt slut. Flaggan antogs den 11 augusti år 1947, tre dagar innan Pakistan utropades att vara en egen stat.